هیأت وزیران در جلسه مورخ ۱۳۶۸.۲.۲۳ بنا به پیشنهاد مشترک شماره ۸۱۵ – ۲۲۶۵.۶۱ -۱ مورخ ۱۳۶۸.۲.۱۹ وزارت فرهنگ و آموزش عالی و تأیید وزارت برنامه و بودجه، آیین‌نامه اجرایی بند ۶ تبصره ۱۲ قانون بودجه سال ۱۳۶۸ کل کشور را به شرح ذیل تصویب نمودند:
ماده ۱ – اجازه داده می‌شود مبلغ یکصد و بیست میلیون (۱۲۰.۰۰۰.۰۰۰) ریال اعتبار ردیف ۱۱۳۵۴۵ قانون بودجه سال ۱۳۶۸ کل کشور بر اساس آیین‌نامه مصرف اعتبارات تحقیقاتی موضوع تبصره ۱۶ قانون متمم بودجه سال ۱۳۶۱ و بندهای “ت” و “ث” تبصره ۷۵ قانون بودجه سال ۱۳۶۲ کل کشور، این آیین‌نامه و تخصیص اعتبار و همچنین موافقت‌نامه مبادله با وزارت برنامه و بودجه به مصرف برسد.
ماده ۲ – سازمان پژوهشهای علمی و صنعتی ایران مکلف است کلیه درآمدهای حاصل از
فروش حق لیسانس فرآیند و محصولات تولید شده در واحدهای نمونه و آزمایشی و سایر
درآمدهای حاصله را به حساب موضوع ردیف ۴۱۹۹۲۰ قسمت سوم قانون بودجه سال ۱۳۶۸ کل
کشور واریز نماید. حساب مذکور‌غیر قابل برداشت بوده و موجودی آن به ترتیبی که
خزانه معین خواهد نمود به حساب تمرکز وجوه که به همین منظور افتتاح شده و یا می‌شود واریز خواهد شد.
ماده ۳ – خرید زمین و ساختمان از محل اعتبار موضوع این آیین‌نامه مجاز نمی‌باشد.
ماده ۴ – مانده وجوه استفاده نشده این آیین‌نامه در هر سال باید حداکثر تا پایان فروردین ماه سال بعد به حساب خزانه واریز گردد.
ماده ۵ – وجوه دریافتی هر سال موضوع این آیین‌نامه تا پایان همان سال مالی قابل
تعهد و پرداخت است هر مقدار از وجوه مذکور که تا پایان سال مالی مربوط با‌رعایت
مفاد این آیین‌نامه تعهد گردیده و پرداخت نشده باشد از محل وجوه دریافتی سال یا
سالهای بعد موضوع این آیین‌نامه قابل پرداخت خواهد بود مربوط بر‌آن که تعهدات
مربوط به هر سال از مبلغ برگشتی وجوه همان سال به خزانه تجاوز نکند.
ماده ۶ – ایجاد هر نوع تعهد از محل موضوع این آیین‌نامه برای سالهای بعد مجاز نمی‌باشد.
ماده ۷ – اموالی که از محل اعتبارات موضوع این آیین‌نامه خریداری یا ایجاد می‌گردد اموال دولتی محسوب می‌شود.
تبصره – اموالی که بنا به تشخیص هیأت اجرایی موضوع ماده ۲۵ اساسنامه سازمان
پژوهشهای علمی و صنعتی ایران در اجرای پروژه‌های تحقیقاتی و یا نوآوری و یا به
عنوان جایزه جهت تحقق اهداف سازمان در اختیار محققین و یا مبتکرین و یا مخترعین
قرار می‌گیرد حداکثر تا مبلغ دو میلیون ریال از شمول این ماده مستثنی است.
ماده ۸ – سازمان پژوهشهای علمی و صنعتی ایران مکلف است گزارش عملکرد درآمدها و هزینه‌ها و عملیات انجام شده را هر چهار ماه یک بار از طریق وزارت برنامه و بودجه برای اطلاع کمیسیون‌های برنامه و بودجه، دیوان محاسبات و وزارت فرهنگ و آموزش عالی ارسال نماید.
میرحسین موسوی – نخست‌وزیر