هیأت وزیران در جلسه مورخ ۱۳۷۰.۳.۱۹ بنا به پیشنهاد شماره ۵۱۶۷ مورخ ۱۳۶۹.۶.۳۱ وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی و به استناد ماده (۳۰) قانون تشکیل سازمان نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران مصوب ۱۳۶۹.۴.۲۴ آیین‌نامه اجرایی قانون مزبور را به شرح زیر تصویب نمود:
ماده ۱ – در این آیین‌نامه سازمان نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران به اختصار “سازمان” و قانون تشکیل آن مصوب ۱۳۶۹.۴.۲۴ به اختصار “قانون” نامیده می‌شود.
ماده ۲ – به منظور تحقق اهداف و انجام وظایف سازمان (موضوع فصول اول و دوم قانون) شورای عالی نظام پزشکی با همکاری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی دستورالعمل‌های اجرای لازم را تهیه و ابلاغ می‌نماید.
تبصره – دستورالعمل‌های مربوط به موضوع بند (۴) ماده (۲) قانون با همکاری مراجع قضایی و وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی توسط شورای عالی نظام پزشکی تهیه و ابلاغ می‌گردد.
ماده ۳ – سازمان پیشنهادهای خود را در زمینه پیشبرد و اصلاح امور پزشکی به وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی و سایر ارگانهای ذیربط ارائه می‌نماید.
ماده ۴ – نظرات و پیشنهادهای سازمان و پاسخ استعلامهای دستگاه‌ها از سازمان توسط رییس کل سازمان اعلام خواهد شد.
ماده ۵ – سازمان در تدوین تعرفه‌های پزشکی و درمانی با وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی همکاری می‌نماید و در جهت اجرای آنها نظام پزشکی شهرستانها اقدامات لازم را معمول خواهد داشت.
ماده ۶ – [حذف ۱۳۷۰/۵/۲۷]
تبصره – [حذف ۱۳۷۰/۵/۲۷]
ماده ۶- [اصلاحی ۱۳۷۰/۵/۲۷]
مسئولین امور پزشکی کشور بنا به تشخیص وزیر بهداشت ، درمان و آموزش پزشکی می‌توانند بدون حسن رأی در جلسات شورای عالی نظام پزشکی و هیأت مدیره نظام پزشکی شهرستانها جهت اظهارنظر شرکت نمایند.
ماده ۷- [اصلاحی ۱۳۷۰/۵/۲۷]
بودجه و تشکیلات سازمان بر اساس پیشنهاد رییس کل سازمان به تصویب شورای عالی نظام پزشکی خواهد رسید.
ماده ۸- [اصلاحی ۱۳۷۰/۵/۲۷]
میزان کمک‌های اختیاری دولت به سازمان همه ساله توسط شورای عالی تعیین و از سوی رییس کل سازمان به دولت پیشنهاد می‌گردد.
حسن حبیبی – معاون اول رییس جمهور